Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms