Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CYP4F3Q08477 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms