Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms