Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms