Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBQ06643 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTBQ06643 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTBQ06643 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms