Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPN11Q06124 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms