Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE3AQ05086 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE3AQ05086 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms