Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms