Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms