Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms