Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSF1Q00613 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms