Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCCQ00597 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms