Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms