Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERVK_113P63132 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P63132 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms