Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK4P57078 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms