Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLTPP55058 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLTPP55058 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLTPP55058 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLTPP55058 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLTPP55058 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLTPP55058 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLTPP55058 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLTPP55058 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLTPP55058 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms