Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN5P54829 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN5P54829 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms