Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23BP54727 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD23BP54727 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms