Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MVDP53602 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MVDP53602 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MVDP53602 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MVDP53602 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MVDP53602 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MVDP53602 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MVDP53602 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms