Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUCLG1P53597 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms