Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRIP1P50238 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRIP1P50238 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms