Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MRE11P49959 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRE11P49959 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms