Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI2P48788 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms