Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF4P48230 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms