Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ME1P48163 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ME1P48163 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ME1P48163 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ME1P48163 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ME1P48163 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME1P48163 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms