Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5OP48047 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5OP48047 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms