Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRCC3P46736 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRCC3P46736 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms