Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RECQLP46063 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RECQLP46063 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RECQLP46063 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RECQLP46063 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RECQLP46063 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RECQLP46063 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RECQLP46063 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms