Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms