Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER3P43115 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER3P43115 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms