Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A4P43007 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms