Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP62P37198 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms