Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA7P36544 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms