Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT2P35908 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT2P35908 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT2P35908 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT2P35908 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms