Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NTF4P34130 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NTF4P34130 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NTF4P34130 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NTF4P34130 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NTF4P34130 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms