Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKARP32238 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKARP32238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCKARP32238 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms