Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA13P31271 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms