Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms