Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRMP28827 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
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