Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms