Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFKBIAP25963 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NFKBIAP25963 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms