Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms