Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2AP24928 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2AP24928 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms