Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGS1P23219 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms