Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRHP20396 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRHP20396 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRHP20396 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRHP20396 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRHP20396 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TRHP20396 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRHP20396 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRHP20396 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms