Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC3P19447 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms