Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPCAMP16422 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPCAMP16422 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms