Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME1P15531 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NME1P15531 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NME1P15531 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NME1P15531 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NME1P15531 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME1P15531 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms