Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAV1P15498 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAV1P15498 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAV1P15498 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAV1P15498 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAV1P15498 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAV1P15498 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAV1P15498 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAV1P15498 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms