Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL11A1P12107 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms